新竹縣政府環境保護局近年因應竹北建案多導致豆子埔溪多處建案工程廢水排放，已加強稽巡查頻率及裁處力道，統計110至112年共計執行83件次豆子埔溪水體污染陳情案件稽查作業，裁處共計37件次，總計罰款金額約達2530萬元；今(113)年迄今，亦已執行14件次作業，針對目前掌握已有污染情事之營建工地，開立限期改善通知單，後續將依違反水污染防治法第30條規定連續並加重裁罰，處三萬元以上、三百萬元以下罰鍰。
為有效降低豆子埔溪污染事件的發生，從源頭開始加強對營建工地於開工前必須提送逕流廢水削減計畫至環保局進行審查，除依規進行現場勘查檢視現場廢水處理設備與措施必須與計畫相符外，且均需完備後才始得進行工程，以確保不會對水體造成污染。另針對違反水污染防治法的營建業者，縮短廢水排放行為限改日數並完成污染清除與環境恢復作業，也從嚴認定處分，嚴懲任何違法行為，必要時依相關法令給予勒令停工處分，避免為了趕工而罔顧水資源和生態環境。
縣府環保局提到，近日有民眾發現有白色顏色的水排入豆子埔溪，為解除民眾疑慮，本局與工務處今(27日)召集施工單位研議，並立即要求停止排放，限5日內完成廢水強化處理設施，施工單位承諾工地怪手機具先暫停開挖出土減少擾動造成水質濁度增加，並新增過濾設施減少排水濁度。縣府要求施工單位先將豆子埔溪污染清理環境復原，後續過濾設施完成改善後排水時應派員至溪邊查看是否仍有疑慮，必要時將高濁度廢水以離場方式處理，不得再排放至溪內。
縣府工務處亦說明，「豆子埔溪水環境及鄰近區域環境改善計畫」已獲得環境部補助1億4600萬元，縣府自籌配合款4140萬元，投入共計1億8740萬元改善豆子埔溪河域；未來工程完成後，豆子埔溪水體將透過側溝系統連接專管至礫間處理場淨化，過濾後的水會再回到上游循環，除了保有水體潔淨，同時也達到乾淨水循環、保持水位等，避免旱期造成含氧量不足，魚群暴斃等問題衍生。
縣府堅持重申對水資源和生態環境的保護承諾，相關部門密切合作，積極推動對豆子埔溪的整治工作，包括水質改善、河道清淤、生態保護等方面，以保護好此一重要的水資源。縣府環保局再次呼籲營建業者務必做好保護環境責任，也堅決採取『預防、勤查、重罰』等實際行動原則，對違法行為不容忍，確保環保法令得以嚴格執行。