全國各地民眾踴躍搶打流感疫苗，今年公費流感疫苗自10月5日開打，各縣市都已出現疫苗量不足的問題，新竹縣今年由中央統籌採購14萬劑流感疫苗，迄今獲配6萬8524劑，由於新冠肺炎影響，民眾接種意願比以往高出許多，縣內109年10月5日至12日接種量已達4萬6926劑，較去年同期暴增5倍，現有庫存量不足以同時間因應縣民需求，為增加民眾接種需求，衛生局已積極協調疾管署疫苗供貨及增加配送頻率。
衛生局指出，為後續疫苗接種作業的公平分配及管控更有效率，衛生局已決定採取3項相關因應措施，第一，為確保民眾至各合約醫療院所有疫苗可接種，啟動各級醫療院所疫苗「每日配額調控」，專人專責視疫苗下貨狀況及民眾接種結存量，再行機動調整配額；第二、本月14日起衛生所暫停社區設站施打疫苗；第三、要求各合約醫療院所公告接種流程及每日接種量，並於現場號碼牌發放或啟動預約制，落實分流措施。