從民國84年開始，台大就說要到新竹縣設立竹北分部，這一晃就是15個年頭。29日台大校長李嗣涔、副校長包宗和、台大醫學院附設醫院院長陳明豐、醫學院院長楊泮池聯袂向縣長邱鏡淳簡報說明原委。邱縣長大為光火，認為台大的簡報是在騙小朋友，佔著毛坑不拉屎，如果真有誠意，應訂出時間表，給縣民一個交代。29日的會議，沒有結論，雙方不歡而散。
26日縣府召開主管會報時，邱縣長就表示，如果台大再不積極訂出設校期程，不排除收回校地。消息一釋出後，台大校方相當緊張，29日台大校長就率團隊向邱縣長簡報。
邱縣長表示，已經15年了，這麼長的時間，縣府已撥給台大的部份校地（22公頃），至今仍在養蚊子，害得現在縣政府正推動中的台灣知識經濟旗艦園區受到鄉親質疑。邱縣長愈說愈氣，他說，台大一直說要在新竹設立5百張病床，根本就沒有的事，不但害本縣就連隔鄰的醫院想增加病床都受到限制，連帶的讓新竹縣的醫療水準老是全省倒數排名第2，所以台大校方的說法根本是在騙小孩，佔著毛坑不拉屎。
邱縣長說，台大的聲譽與名望令人敬佩，所以建議台大以財經科技管理為主軸，來發展新竹縣竹北分部，但首要條件要趕快訂出時間表。如果台大校方願意的話，已有美國知名廠商想要與縣政府合作，這點縣政府可以居中牽線，朝產、官、學、研4大方向來發展，新竹縣會更有希望
台大校長李嗣涔聽到邱縣長一連串的砲轟後，很尷尬的表示，其實台大89年當初只是很單純的要在竹北設立分部，後來行政院方面希望台大也能同時主導新竹生物醫學園區，就這樣一直糾纏不清，到了民國95年，台大才知道一切要自籌經費，於是96年台大開始募款，近10年已募得2百億，成果豐碩，台大的募款能力不容質疑。至於邱縣長所指的圍籬問題，台大會在最短時間內，種植具有穿透性的樹種美綠化。
邱縣長表示，既然台大的募款能力那麼強，就要趕快訂出期程，不要讓資源放在那裡浪費，只蓋了一棟產學合作研發大樓應景，請台大要地盡其利，因為那塊土地非常值錢，如果招商的話，會是一隻金雞母。
縣議會副議長不克出席，特委託縣府發言人張建家發表4點聲明。張副議長說，自始他就反對設校案，因為知道時間會拖很久，果不其然，一拖就是15年，如果當初以觀光夜市發展的話，15年的收入相當可觀。
其次張副議長認為台大校方沒誠意，簡報千百次還是原地踏步。將要求縣政府研擬收回校地的相關法令，最後張副議長建請縣政府，爾後無論是交大、台科大、清大的設校案，都要審慎評估，訂出期程、進度、規模，不要像台大一樣，到最後兩頭空。
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